Voici une proposition de protocole de prise en charge du matériel (biologique comme prothétique) explanté chirurgicalement, développé par l'équipe de Lyon :
Il est admis que les échantillons de tissus ou de matériel prothétique cardiaque obtenus lors d’une chirurgie cardiaque doivent être pris en charge par les laboratoires d’anatomopathologie et de microbiologie en vue d’une analyse histologique, de cultures bactériennes et fongiques et, en cas de besoin, d’analyses de biologie moléculaires (2023 ESC Guidelines). Ces dernières, souvent décidées en RCP en fonction du contexte clinique et épidémiologique peuvent comprendre des PCR pan microbiennes (16S ou 18S) suivies de séquencage Sanger ou NGS, du NGS shot gun (cad sans amplification préalable), des PCR ciblées comme par exemple : PCR Staphylococcus aureus, PCR Staphylococcus spp, PCR Streptococcus spp, PCR Tropheryma wipplei, PCR Bartonella spps, PCR Coxiella burnetii, PCR Cutibacterium, PCR Brucella spp, PCR Enterobacterales, PCR Mycobactéries, etc…
En revanche aucune recommandations internationale ne précise la manière dont les analyses histologiques et microbiologiques doivent être coordonnées, en particulier comment procéder pour maximiser la cohérence des résultats histologiques et microbiologiques. En raison du caractère parfois focales des atteintes infectieuses au niveau du tissu valvulaire, Il peut arriver que l’histologie et la microbiologie soient discordantes comme par exemple un résultats de PCR positif à Coxiella burnetii et une histologie excluant le diagnostic d’endocardite infectieuse. Ou à l’inverse une histologie en faveur d’une EI active et une culture et une batterie de PCR négatives chez un patient qui présente un tableau d’EI avérée.
Pour toutes ces raisons un groupe de microbiologistes, anatomo-pathologistes et cliniciens de l’AEPEI a proposé dès 1995 (Mainardi JL, 1995) une procédure de prise en charge du matériel cardiaque explanté dont l’objectif est de de maximiser la probabilité de concordance entre les différents examens tout en optimisant la qualité les examens issus des différents laboratoires.
Cette procédure, schématisée dans la figure ci-joint, implique que l’ensemble du matériel explanté soit envoyé dans un contenant stérile au laboratoire de Bactériologie sans fragmentation de ce matériel au bloc opératoire comme cela est habituellement pratiqué. Au laboratoire de Bactériologie la pièce opératoire est disposée, en conditions de manipulations stériles (L2), dans une boite de Pétri stérile de manière à exposer au mieux les zones pathologiques. Cette boite, refermée, est ensuite emportée au laboratoire d’ACP en vue d’un examen macroscopique conjoint par l’ACP et la Bactériologiste. Cet examen conjoint, éventuellement réalisé à distance grâce à la télétransmission en vidéo, permet de désigner les zones pathologiques qui sont tracées dans le dossier de laboratoire de bactériologie et dans celui d’anatomopathologie s’ils sont distincts. Les zones pathologiques sont ensuite découpées stérilement au laboratoire de bactériologie en essayant, pour chacune de ces lésions, de conserver intact un équivalent analysable par l’anatomopathologiste et, si possible, de conserver des fragments en vue d’analyses moléculaires. Le tissu valvulaire restant est ensuite transmis au laboratoire d’anatomopathologie pour la prise en charge spécifique.
Les examens microbiologiques et histologiques réalisés sur les fragments de tissu valvulaire ont fait l’objet de recommandations que nous ne développerons pas ici (Remic, 2022).
Delgado, V., Ajmone Marsan, N., de Waha, S., Bonaros, N., Brida, M., Burri, H., Caselli, S., Doenst, T., Ederhy, S., Erba, P. A., Foldager, D., Fosbøl, E. L., Kovac, J., Mestres, C. A., Miller, O. I., Miro, J. M., Pazdernik, M., Pizzi, M. N., Quintana, E., Rasmussen, T. B., … ESC Scientific Document Group (2023). 2023 ESC Guidelines for the management of endocarditis. European heart journal, 44(39), 3948–4042. https://doi.org/10.1093/eurheartj/ehad193
Mainardi JL, Vandenesch F, Casalta JP, N’Guyen J, Benoit C, Tissot-Dupont H, Maugein J, Weber M, Bouvet A, Etienne J, Loire R, Vissuzaine C, Bruneval P. Recommandations pour le diagnostic microbiologique et l’étude anatomopathologique des valves cardiaques au cours des endocardites infectieuses. Bull Soc Fr Microbiol. 1995 ;10(1) :12-15
Remic, Référentiel en Microbiologie médicale. Editeur : Société Française de Microbiologie, Eédition 7.1, 2022.
